约瑟夫·阿基诺顺利入主马拉卡南宫后，迅速进行了一系列的人事变动，政府中杜尔特提拔上来的官员以各种借口被弹劾或直接撤职，在菲律宾政府中想要找出一个没有任何污点的官员根本不可能，可以说被替换掉的官员没有一个是冤枉的。
军队是人事调整要血腥的多，菲德尔·阿基诺少将麾下的特种作战团对支持杜尔特总统的北吕宋军区和国家首都军区的主要将领展开了“斩首”行动，没有防备的两个军区的主要指挥官悉数遇刺。国家首都军区的第1步兵师在师部机关被特种作战团袭击后，两个步兵连和宪兵部队在各自军官的带领下对袭击师部的特种部队展开了攻击，五十多名特种部队被暴怒的第1步兵师官兵直接全部打死。直到菲德尔·阿基诺少将调来了更多的部队和轻型快反连才平息了第1步兵师的争斗，差点让这场一帆风顺的政变出现了意外，要知道第1步兵师就驻扎在马尼拉市郊区，一旦该师被组织起来全面反抗的话，接手马尼拉市都没有太大的问题，阿基诺家族在马尼拉市拥有的力量只有菲德尔·阿基诺少将的特种部队，特种作战部队的多支部队在其他地区执行任务，马尼拉市的兵力也就千余人。
两天的血雨腥风，让约瑟夫·阿基诺顺利控制了整个菲律宾，至于杜尔特总统，在畏罪潜逃的途中遭遇车祸身亡，尸体已经被火化。名声已经被约瑟夫·阿基诺弄臭的杜尔特总统已经快速被遗忘了，在肮脏的政治中这样的事情很是常见。
至于被作为引子的“珍珠”号游轮，新成立的阿基诺四世政府，选择了以保护游客生命为第一要务，同摩伊组织展开了谈判，在支付了三千万美元的赎金后，所有人质获释。在人质获释后的当天夜间，菲律宾特种部队突袭了摩伊组织的一处秘密营地，击毙摩伊组织武装人员十七人，算是给被杀死的游客一个交代。
上台之后的约瑟夫·阿基诺总统宣布废除杜尔特执政时期与中国政府签署的一系列出卖菲律宾权益的合同，与美国、日本和澳大利亚展开广泛合作。同时考虑到中国军队控制了台湾岛，严重威胁到吕宋海峡和吕宋岛北部的安全，约瑟夫·阿基诺总统宣布允许美国在菲律宾拥有更多的军事基地、驻扎更多的军队，同时宣布向日本自卫队开放军事基地，允许日本自卫队进驻，以便日本自卫队更好的保护正被中国军队严重威胁的南海航线和吕宋海峡航道。
约瑟夫·阿基诺宣布允许美日军队在菲律宾驻军的当天，美国空军和日本航空自卫队的大量运输机就飞抵了菲律宾的克拉克、巴萨、费尔南多、宿务、公主港、三宝垄、达沃等机场，将大量的部队和装备投送到了菲律宾。
日本自卫队在此之前在非洲的吉布提拥有一个军事基地，不过吉布提基地周围便是中国军队、美军和法军的基地，实战价值不大，现在菲律宾和美国允许日本在菲律宾设立军事基地和驻军，对于驻军的规模，美军没有给出限制，这让日本政府和自卫队欣喜若狂。空中自卫队成为了驻军的急先锋，C-运输机满载着空自的工程兵分队、勘测分队、地勤分队和第1空降旅团的两个营抵达了菲律宾的克拉克空军基地、桑莱岬空军基地和宿务马克坦空军基地，为后续驻军进行探路。
美日军队的先遣队进驻的时候，美日两国军方的代表和菲军的代表还在菲律宾国防部大楼中商讨中更详细的驻军方案，商讨的也不只是驻军方案，还有菲律宾军队的改革方案。
行动效率之高出人预料，美日菲三国军方经过两天的谈判之后，菲律宾军队就拿出了改革方案，在已经部署到了菲律宾境内的美军第步兵师第斯瑞克旅战斗队和日军第1空降旅团的支持下，改革方案被立即付诸实施。
菲律宾陆军原本下辖的北吕宋、南吕宋、中部、西部、棉兰老、国家首都六个地区军区司令部进行了调整，南吕宋军区被撤销，并入中部军区。从棉兰老军区司令位置上挪出来的新任总参谋长桑托斯·加西亚上将不希望看到有人再次上演他的做法，阿基诺家族是这次政变的最大获益着，桑托斯·加西亚的棉兰老军区的作用不可估量，因为一旦菲德尔·阿基诺少将特种部队的突袭行动失利的话，棉兰老军区的主力将挥师北上，支持菲德尔·阿基诺少将挽救菲律宾命运的“正义”行动。在桑托斯·加西亚上将的要求下，棉兰老军区被拆分成了东棉兰老和西棉兰老两个军区，军区司令部分别设立在达沃市和潘加迪安市。
军区进行调整的同时菲军开始大规模征兵，按照改革方案，菲律宾军队的总兵力将从11.万人扩充到17万人，陆军部队在八个步兵师、五个工兵旅、一个轻型装甲旅、一个修建营和一个陆军航空兵营的基础上增加四个步兵师、一个轻型装甲旅、三个装甲骑兵营和两个陆航营。空军多个只有空架子的中队开始补充兵员，准备接受新购买的飞机和直升机。海军也是如此，大量的水兵被调往了苏比克湾、甲米地桑莱岬、三宝颜、宿务海军基地，接受美日教官的培训，准备接受新的作战舰艇。
美日两国政府知道先进的武器装备菲军买不起、用不起，也不会用，美日两国援助的武器装备基本上是从储备仓库中拉出来的封存装备，即便如此，菲军也是欢喜不已，尤其是菲律宾空军接受了日本政府赠送的二十架F-1战斗机后，菲律宾空军司令恨不得抱着前来进行交接工作的日方人员亲上几口。
日本的74式主战坦克、7式越野吉普车、OH-6轻型侦察直升机、海军巡逻艇，让菲律宾军方对于日本人的好感大增，面对着日本人提出的让菲律宾军队的工兵部队帮助日本修筑机场、港口和陆军兵营的请求直接满口答应，乐呵呵地派出接受人员跟在日本自卫队官兵们学习这些武器装备的使用。
美国军队能够提供菲律宾的武器其实不多，主要是美军封存的许多武器的技术含量对于学历水平普遍不高的菲军来说都太高了，维护成本也让菲军吃力。最终大量提供给菲军的主要都是陆军武器，并且都是菲律宾陆军已经装备了的型号，V-100/150轮式装甲车、M11装甲车、UH-1系列通用直升机等几种主战武器。这些武器都是免费赠送给菲军的，但菲律宾陆军步兵部队的武器美国政府要求菲军必须使用美制的，这些武器都是菲律宾政府花钱购买的，包括“陶-”反坦克导弹和“毒刺”便携式防空导弹，让菲律宾陆军终于装备上了导弹武器。
除了美国和日本之外，另一个积极为菲律宾提供武器装备的国家就有些出人意料了，不是在菲律宾政变中积极为阿基诺四世鼓吹的澳大利亚，而是在“珍珠”号人质危机中被杀了四个本国公民的韩国政府。韩国政府宣布将再向菲律宾空军提供八架FA-50战斗机，同时向菲律宾空军赠送二十架退役的F-5E战斗机，更大的援助是海军，韩国政府表示，三艘退役的“东海”级轻型护卫舰和两艘退役的“浦项”级轻型护卫舰可以低价出售给菲律宾。
得知这个消息的菲律宾政府立即派出了提拔为国防部长不久的维克多恩·考普斯上将率领的军方代表团前往了首尔，与韩国政府展开进一步的谈判。
“菲律宾陆军的主要任务是肃清境内的菲共和新人民军武装，如果说摩伊、摩解这两个组织会威胁到棉兰老岛的稳定的话，菲共和新人民军威胁到的就是菲律宾的政权，他们与中国共产党有着共同的信仰，最容易被中国政府利用，清剿他们应该是菲律宾陆军的重中之重。菲律宾空军和海军的任务是在南海的黄岩岛和南沙群岛进行扩张，通过不断的骚扰来迟滞中国军队在南海的侵略扩张。考虑到菲律宾海军的实力较弱，美国政府会在短时间内将另外两艘汉密尔顿级巡逻舰交付给菲律宾海军，同时会提供低额贷款帮助菲律宾海军将法国人扣在手中的两艘护卫舰购回。”在维克多恩·考普斯上将抵达首尔与韩国政府和国防部的代表展开谈判的时候，驻菲美军司令威利斯·兰兹中将也再次拜访了约瑟夫·阿基诺总统，菲律宾军队享受着美国提供的福利，那他们的任务也必须承担起来。
“如果那四艘大型战舰能够加入菲律宾，加上韩国政府的五艘轻型护卫舰，我们的海军力量将会获得极大的提升，在马拉延群岛面对中国挑衅的时候也能够更加自信和轻松。”约瑟夫·阿基诺知道美国人需要的是啥，他也很乐意那样去做。
中国制造的那些物美价廉的商品对于阿基诺家族的产业冲击力巨大，菲共的土地改革纲领更是涉及到家族的根本利益，其实无论有无南海，约瑟夫·阿基诺和他的家族都会站在中国的对立面。（未完待续）