调派水师也被否决，理由是浑河太小，不适合水战，调派辽东的水师都被调往镇江。调派大型火炮支援辽东的事也被大幅削减，只有五十‘门’，并且包括南京启运的七‘门’大炮，盖辽军分的其中五‘门’，沈阳城还有十五‘门’，理由是全国各地都缺少大型火炮，没有上奏的小火炮倒是有两百‘门’。
建议朝廷任命徐光启为火器巡抚，专‘门’负责铸造火炮和制造火枪的事当然被否决，理由很简单，不符合祖宗之法。火器能值得设立巡抚？笑话！这不过是旁‘门’左道的雕虫小技罢了。
万历皇帝最后是基本批准通过，只是辽阳防御仍由卞为鸾担任，野战军也只有三万兵力，再增加了两百‘门’小火炮及火‘药’弹‘药’各五万斤。内阁及给事中经过十天争执通过后，圣旨发辽东。
辽东经略熊廷弼接到圣旨后，当然是气的不行，火冒三丈，一个小小的参将竟敢对军国大事指手画脚的，满朝连带皇帝也不是好东西。臣在离京之时曾上疏毋窘臣用，毋缓臣期，毋中格以沮臣气，毋旁挠以掣臣肘，毋独遗臣以艰危，以致误臣、误辽，兼误国也，半年不到就变卦啦。
马上上疏万历皇帝，先把卞为鸾和朝中大臣痛吗一遍，皇帝就给点面子，不骂了，表示要独掌辽东兵权，依自己的战略行事，否则另请高人，难道要萨尔浒之战重演，令箭催而主帅殒命，马上催而三路丧师，臣何敢复蹈前轨。熊廷弼当天就派人斥责卞为鸾，闲事少管，管好盖辽军就得了，军国大事岂是武将能指手画脚的。
万历皇帝接到熊廷弼上疏，立即‘交’给方从哲，指示‘交’廷议，廷议结果当然是要熊廷弼按旨办事，不得有误，廷议为大明的最高决定，就是万历皇帝也得遵从，即使不从，也得留中不发，哪敢公开反对的，你熊廷弼算老几啊，比万历皇帝还大，何况近半年也不见什么大动作，就知道防守，当缩头乌龟是不是！
卞为鸾接到圣旨后，权衡后也是立刻上疏请求，表示野战军只要这三部人马组成，‘抽’调辽东各军一万五千人，足以影响辽东各军战力，野战军依然归属辽东经略战略指挥，野战并不是决战，建议野战也一般是防御‘性’质的，决定‘性’的进攻建奴需要两三年时间准备才能展开，第二是请求徐光启担任辽东监察御史兼督造火器及督练新军，地点建议在海州。第三是请求两广总督许弘纲支援盖辽军红夷大炮十‘门’或者由盖辽军购买。
万历皇帝接到卞为鸾上疏，立即‘交’给方从哲，指示按照卞为鸾的奏疏重新下诏书。
内阁首辅方从哲经过一番考虑后决定遵从皇帝旨意，肯定不能再开廷议，廷议的主流意见是进攻再进攻，恨不得搞个十万大军的规模进攻，圣旨经皇帝及内阁首辅签署后，却给六科给事中姚宗文魏应嘉驳回，坚决不同意卞为鸾上疏中的第一项，表示一万五的野战军成不了什么大事，坚持至少三万人的野战军兵力，第二项第三项则被批准。御史台冯三元颅恺等一并上疏，炮轰熊廷弼半年来一事无成。
不得已，徐光启担任辽东监察御史兼督造火器及督练新军先由圣旨下诏，命其领火器工匠百人及所部新军两千余人北上援辽，盖辽军可以南下购买红夷大炮十‘门’，两广总督等地方官员需协助。
最后经过一个多月的较量，朝廷谁也没有落下风，半斤对八两，万历四十八年一月，皇帝下中旨给熊廷弼及辽东各军，野战军只由三军组成，熊廷弼全权负责辽东事务。
在仔细权衡之下，熊廷弼不得已接下万历皇帝的三无中旨的诏书，文官接中旨，这是罕见的大事，不接中旨就得接圣旨，自己损失更大，简直倒大霉。
辽东各军则没有文官的权势，只能乖乖的接下中旨。直到一月底，野战军被分成两部，盖辽军仍在沈阳，川浙军在虎皮驿驻扎下来，并没有如卞为鸾集中兵力的初衷，这是熊廷弼力争的结果，在熊廷弼的辽东战略设计中，虎皮驿和沈阳、奉集堡组成防御铁三角，是护卫辽东的坚固防线，多数辽东‘精’兵都调集到这三个据点，像囚笼一样困住后金，最后准备沿浑河东进，剿灭后金。
奴尔哈赤也是觊觎辽东‘肥’沃的土地，都城先从赫图阿拉迁到界藩，又从界藩迁到萨尔浒，步步为营，准备一举拿下辽沈这块‘肥’‘肉’。
接下来的十二月和一月份，卞为鸾的工作是完成对后金的战争计划，整个计划为了保密，因此没有跟任何人商议，秘密上奏皇帝，希望能够保密。
制定战争计划之前先要对敌我双方的力量判断，即敌国政治、经济和军事有一个总体的印象和优点缺点，然后是我们的政治、经济和军事总体的印象和优点缺点。
臣认为建奴在政治方面，建奴的权力明显的要比大明集中，而且可以说基本就是一个派系，即奴尔哈赤派，没有值得一题其他政治力量。
经济方面，人口很少，估计只有四五十万‘女’真人，物资缺乏，建奴主要依赖农牧业，手工业商业不发达，国家只有很少的财力物力，劫掠大明也是其一大财力物力来源。其国土价值也就是勉强养活五十万‘女’真人。
军事方面，建奴的优势主要在质量优势方面。军队战力强，明显的高于明军，官兵尚武‘精’神大大强于明军，其次在于其机动‘性’，再次是冲击力。其将领大多也是经历战火洗礼，指挥能力明显高于明军将领。兵力数量和兵源补充是其最大的问题。
政治方面，大明的权力明显不如建奴集中，皇帝的权力也远远不如奴尔哈赤，而且内部党派纷争相当的严重，彼此拆台，哪一方在台上日子也不好过。文臣武将对双方的战力没有足够的认识。